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AI打造3D細胞模型,揭示細胞微觀世界的全新方式

發(fā)布時間:2024-08-29 15:35:50 瀏覽量:129次

艾倫細胞科學研究所(Allen Institute for Cell Science)由微軟聯(lián)合創(chuàng)始人Paul Allen在西雅圖成立,其研究人員創(chuàng)建了第一個針對人類活細胞的可預測3D模型。借助此模型,科學家可以在計算機屏幕上以數(shù)字化的方式呈現(xiàn)、甚至控制細胞行為。

此模型名為“艾倫集成細胞”(Allen Integrated Cell),是利用數(shù)萬張高清細胞圖像進行深度學習訓練的結果。它能夠識別亞細胞結構并投射細胞的3D多層圖像,顯示其所有組成部分是如何同時相互作用的,此種呈現(xiàn)方式前所未有。

“這是迄今為止科學界中最令我驚嘆的事情,”艾倫細胞科學研究所常務董事Rick Horwitz說道。“現(xiàn)在,我們可以三維形式在影片中動態(tài)觀察細胞的內部工作原理?!?/p>

為創(chuàng)建此模型,研究人員使用了NVIDIA GPU、NVIDIA DGX Station AI超級計算機和cuDNN加速PyTorch深度學習框架,使用識別原子核等細胞結構的蛋白質標簽來研究圖像。

超越緩慢且昂貴的傳統(tǒng)工具

目前,科學家已經使用熒光顯微鏡觀察了細胞的內部結構,這個過程成本高昂、緩慢且具有破壞性。在新的模型中,研究人員使用卷積神經網(wǎng)絡重建3D透射光和熒光細胞圖像在大的細胞結構方面的關系。

“這是觀察人類活細胞內部結構的全新方法,”Rick Horwitz表示?!熬拖竦谝淮慰吹秸麄€細胞一樣。在未來,這將影響藥物發(fā)現(xiàn)、疾病研究以及我們進行人體細胞基礎研究的方式。”

艾倫集成細胞模型甚至可以預測有絲分裂事件的動態(tài)。利用諸如此類的功能,對于癌癥研究、制藥以及生物技術等領域,該模型將有可能徹底改變未來的細胞研究。

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